このようにいわゆる「勝ち組経営者」として名を馳せた小林であったが、2005年には長崎で立ち上げたフードテーマパーク事業が破綻。
2006年2月には当該事業の債権者集会に出席し、プロジェクト責任者として「破産は裏切り行為。債権者に迷惑をかけて申し訳ない」と謝罪した。

その後、小林の会社は清算された