エレンとアルミンの場面は漫画版もアニメ版も意図は一緒だよ

ただアニメ版は原作版で伝わりにくかった事を補完してくれた
特に「虐殺してくれてありがとう」は作者の意図が伝わらず海外で問題視されてたからね

俺もアニメ版見るまでは「虐殺してくれてありがとう」の意味はいまいちよく分からなかった