リニア問題初心者は、静岡新聞のこの記事が一番分かりやすいぞ
水問題の発端が分かりやすく書かれてる

南アルプスルートの絞り込み　大量湧水、考慮の跡なく【大井川とリニア　最終章　環境アセスは機能したか①】｜あなたの静岡新聞
https://www.at-s.com/news/article/shizuoka/1016999.html
リニアルートはまっすぐではなく山梨で南に折れ曲がってるんだが、
その理由は巨摩産地が脆弱な地質で大量湧水する懸念あるとJR調査で分かったからというもの
結果、折れ曲がって静岡県で大井川水源地下ルートになって、その後の調査で同じく大量湧水の懸念あるのにルート変更せず
https://www.at-s.com/news/images/n102/1016999/rinia2.jpg