Windowsのユーザーフォルダ内のデフォルトのフォルダ群使ってる？
あれを嫌ってたけど結局あれに従った方が何かと管理が楽なんだと思う
ルートから遠いってのがイラつくけど結局Windowsがユーザーフォルダを基準に動作するから別の体系で整理してもソフト毎に毎回基準ディレクトリ変えなきゃならんし
別ドライブの場合はまた話は異なるけど
基準ディレクトリ以下はファイル/フォルダ自体がごちゃごちゃになってもEverythingでどうになるからもはや大して気にしてないけど