Evernoteの真骨頂は検索とWebクリップなんだよな
とくに検索機能は強力でPDFや画像の中身まで検索してくれるのは他にない

Webクリップも強力
簡易ページでのクリップが装飾をそぎ落として保存してくれるのが大変ありがたい

これらの代替となると、機能は劣るけどやっぱりMicrosoftのOne noteしかないと思う
目的や役割も合致するアプリだしな