ジオンの悪性を云々ってより

コロニーを落としたとなれば、設定としてそのコロニーはどうした？って話になるし
落とすコロニーの住民をどうするんだ？ってもなる

そう設定を考えた時に
本編内でマハルをソーラレイに転用する時の住人強制疎開の混乱の事を考えれば
自国のコロニーじゃないってなれば、中の住人は殺しちゃったって事にするのが
作る設定としては普通な流れだと思うけどね